Molecular Biology Utilities Suite 實驗室核心前端工具箱
核酸濃度計算工具 (Nucleic Acid Concentration Calculator)
吸光值測定後,計算定量 DNA / RNA 或合成寡核苷酸的濃度。
輸入樣品的分子量(MW)與消光係數(ε),系統即會根據所測得的 OD260 吸光值,即時同步換算出體積莫耳濃度(M)、微莫耳濃度(μM)與重量濃度(mg/mL)。
消光係數(ε):用來衡量特定物質對特定波長光線吸收能力強弱的物理量。
雙股 DNA (dsDNA): 消光係數通常以常數換算,在 1 OD260 時約等於 50 μg/mL。其整體的摩爾消光係數通常依鹼基數相加計算。
單股 DNA / Primer (ssDNA): 由於沒有雙螺旋的「減色效應(Hypochromism)」,鹼基完全暴露,因此吸光能力比雙股強。一條常見的 20-mer 引子(Primer),其消光係數 ε 通常落在 150,000∼250,000 M−1⋅cm−1 之間。
RNA: 在 1 OD260 時約等於 40 μg/mL。
Primer 回溶與釋釋計算器 (Primer Reconstitution & Dilution)
新合成引物(Primer)乾粉的開管配製,以及後續實驗工作液(Working solution)的稀釋。
輸入引物總量(nmol)與目標儲備液濃度(Target Stock),立刻計算出所需加入的溶劑體積。
工作液稀釋: 採用 C1V1=C2V2 公式,自動拆解出「應吸取的儲備液體積」與「應加入的稀釋溶劑體積」。
PCR 反應配方計算器 (PCR Master Mix Calculator)
批量 PCR 反應液(Master Mix)的調配與分裝設計。
支援「預計反應管數」與「包含耗損管數」的動態連動估算,並提供可自由「+ 新增成分」的彈性計算表格。
Tm 值與 PCR 溫度循環設定 (Tm Calculator & PCR Thermal Program)
PCR 增幅反應的熱循環條件設定與優化。
輸入雙向引子序列,即可分析 Tm 值與 GC% 含量,使用最佳化公式(Ta=Tmmin−5∘C),給予建議的黏合(Annealing)溫度。